懷孕三、四周內不知情，流感高燒... - 感冒藥

我26歲，目前懷孕預估約三週或者四週，如果沒有預估錯誤應該是三週左右吧？
前天買了驗孕盤顯示兩條線，昨天跑去婦產科檢查，因為孕期很早，加上本身子宮後傾的關係，所以超音波與陰道超音波都還沒照到我的小種子，但問題是在我知道自己懷孕之前得了一場流感，而且高燒三天...，所以想請教各位專業的。
事情是這樣的，我平均30天mc來一次，最後一次mc是2/28，之後3/29身體感到微微不適，3/30開始連燒三天，最高燒到39.9度，當時認為只是小感冒沒去看醫生，吃了家裡的感冒成藥沒有用，吃了退燒藥也沒用，剛好又是週末，晚上燒到了39.9，我又堅持不掛急診，於是我男友去了藥局幫請藥師幫我抓藥先擋著，當晚吃了就急速退燒，一整個晚上流汗換了六套衣服，不過隔天又開始燒了...，後來知道這是這次流行性感冒的症狀，總之這場病拖了很久，隔了幾天燒退了但咳不停，終於在4/3日跑去看家醫師，我的家醫師以前是婦產科醫師，他幫我照了超音波，當時一樣照不到什麼，當時子宮內膜0.3cm。因為我的腸子本身就不好，腸子很懶，不愛蠕動，所以我都固定吃益生菌來保養我的爛腸子，但一旦生病就算吃益生菌一樣不會便便，所以醫生除了開感冒藥以外，也開了一點瀉藥給我，就這樣，在我得知自己懷孕之前，得了一場流感和吃了一堆藥，這堆藥還讓我排的汗都是代謝後的藥味，床單棉被衣服也都是藥味，而感冒的後續的咳嗽等鼻塞也是到了最近這幾天才好多。
昨天去看婦產科，子宮內膜0.8cm，做了抽血檢查，妊娠指數落在1451，我查過懷孕初期吃藥對bb要不沒影響要不就是直接流產，這部分既然沒事我也沒啥顧慮，但因為流感時我沒有好好照顧自己，看一些網路上醫師報導說，懷孕初期若被病毒引起的流感侵襲，又沒有好好照顧，對bb可能會是一大傷害，有可能造成神經系統的影響，我反應給婦產醫師，醫師似乎也理解我的顧慮，沒有太大推翻我的意思，似乎也認同病毒可能會影響到BB著點，大家覺得這樣的情況，我還適合繼續讓胚胎長大嗎？或者冒著生出畸形兒或腦部、脊椎發育不全的的機率繼續冒險懷孕下去？