抗生素如何使用才安全呢？ - 副作用

我兒子兩歲快七個月，體重14.5-15kg。他本來扁桃腺炎（醫生說有發膿）醫生開了抗生素Amoxil(500) 0.33 Cap，並沒有告知是抗生素要服藥十天。我們讓他用藥三天後停藥，結果開始咳嗽，隔天晚上再去看醫生，服了兩包含有Amoxil的藥。結果次日早上又開始發燒，又去看醫生，醫生診斷為氣管炎、咽喉及扁桃腺紅腫。請問：
一、抗生素Amoxil(500) 0.33 Cap才服三天，中斷一天，再服一天，又換藥成抗生素KEFLOR (250mg) 0.58 Cap。會不會有抗藥性呢？KEFLOR是不是還要再服十天才可以？
二、KEFLOR(250mg) 0.58 Cap對二歲半的孩子來說是安全的嗎？它與Amoxil(500) 0.33 Cap的差別在哪裡？
三、如果不是細菌感染，只是病毒感染，服了這麼多抗生素會有何副作用呢？會不會影響以後的免疫力？